Jan 18, 2024

Public workspaceGewebesammlung Frischgewebe Zystektomie V.3

This protocol is a draft, published without a DOI.
  • 1Charité
Open access
Protocol CitationAnnika Fendler, Bettina Ergün 2024. Gewebesammlung Frischgewebe Zystektomie. protocols.io https://protocols.io/view/gewebesammlung-frischgewebe-zystektomie-c5kuy4wwVersion created by Bettina Ergün
License: This is an open access protocol distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License,  which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited
Protocol status: Working
We use this protocol and it's working
Created: November 28, 2023
Last Modified: January 18, 2024
Protocol Integer ID: 91508
Keywords: Gewebesammlung, Gewebeaufarbeitung, Blase
Abstract
Dieses Protokoll beschreibt die Schritte für die Sammlung von Frischgewebe, Gefriergewebe (Fresh-frozen), und Blut von Patienten mit Harnblasenkarzinom nach Zystektomie.  

Verwandte Dokumente: 
Protokoll zur Blutaufarbeitung 
Guidelines
Beschreibung der biologischen Proben:
ProbentypKurzbeschreibung ProzessZweckBemerkung
1 x koaguliertes Blut in CAT tubes NAAufarbeitung und Lagerung von Serum Findet im Rahmen der Biobank Sammlung statt. Zuständig: Michela de Martino 
2 x EDTA NA Aufarbeitung und Lagerung von Vollblut und Plasma Findet im Rahmen der Biobank Sammlung statt. Zuständig: Michela de Martino 
Frischgewebe Sammlung in Transportmedium in 15 ml Falcon.  Aufarbeitung zu Tumorfragmenten und/oder Einzelzellen Zuständig: Annika Fendler, Bettina Ergün 
Gefriergewebe (Fresh-frozen) Sammlung in 2 ml Kryoröhrchen, schockfrosten in LN, Lagerung bei -80°C Lagerung für verschiedene Anwendungen Findet im Rahmen der Biobank Sammlung statt. Zuständig: Michela de Martino 
Tabelle 1: zu sammelnde biologische Proben

Einschlusskriterien für Patienten: 

-

weitere Richtlinie zur Probenentnahme: 

  • falls der Tumor zu klein ist: fresh frozen priorisieren
  • falls kein Tumor zu erkennen ist: Normalgewebe nur, falls schon TURB-Material vorhanden ist oder falls Bedarf für bestimmte Experimente ist

Verantwortliche:

Sammlung für folgende Arbeitsgruppen:  AG Fendler (Organoide)  Urologische Forschung   
Zuständige Labor:  Annika Fendler, Tel.: 515040  Michela de Martino, Tel.: 515040  Bettina Ergün, Tel. 515128/615009 
Zuständige Klinik für Urologie: 
Antonia Franz  Kira Kornienko, Tel. 615166 
Zuständige Pathologie:  Simon Schallenberg, Tel.: 536054   Florian Roßner, Tel. 
Sefer Elezkurtaj 
Zuständige Klinik für Radiologie:  Markus Lerchbaumer, Tel.: 657084 
Kontakt Patientenmanagment  Silvia Stark, Tel.: 615028 
Nadine Stremlau, Tel.: 615029 
Kontakt Schnellschnitt  Ines Görmar, Tel.: 536136/636136   
Materials
Transportmedium 
pro 15 ml TubeAnteil [%]BestandteilCat #Bemerkungen
10 ml98MEM 31095-029  
0,2 ml2Zellshield (100x) 13-0050 vor dem 15.5.2023 wurde nur 1 % Zellshield verwendet 

 
Gefriermedium 
MengeBestandteilCat #
10 ml DMSO  
90 ml FBS FBS. S 0615 

 
50 ml Falcons 
2 ml Kryoröhrchen
Stanzen 6 mm (hinterlegt im Schnellschnitt) 
Gewebeschein + Stifte 
Sterile Glas-Petrischale und Pinzette 
Before start
Vor der OP:  Patienten werden von Michela de Martino im Rahmen der Biobank Planung identifiziert und gegebenenfalls gemeinsam besprochen.  Die Patientenliste mit Datum der vorstationären Aufnahme wird jeweils am Donnerstag an das Patientenmanagement geschickt. 
Wenn ein Patient die EVEs unterschrieben hat und Blut abgenommen wurde, wird in SAP im Bemerkungsfeld für das OP-Personal vermerkt, dass sie die entnommene Blase nativ in das Schnellschnittlabor schicken sollen.  Ebenfalls am Donnerstag der Vorwoche eine Email mit Gewebewünschen an ines.görmar@charite.de aus dem Schnellschnittlabor schicken und ggf. am OP-Tag nochmals telefonische Kontaktaufnahme.  Änderungen im OP-Plan sollten im besten Fall täglich überprüft und mit dem Team abgesprochen werden.    Am Tag der OP: 
Vorbereitung: 
Lokalisation des Tumors und Vortherapie recherchieren
Flüssigen Stickstoff, sowie die Tüte mit Gewebescheinen; Tubes und Stiften bereit haben. 
Gewebesammlung im Schnellschnitt
Gewebesammlung im Schnellschnitt
Nach Rückmeldung des Schnellschnitts geht eine Person zur Gewebeentnahme.  
Tüte Blase und Stickstoffbehälter mitnehmen.
Arbeitsanleitung (siehe Abbildung) beachten.

Arbeitsanleitung
4x 15 ml Falcons mit 10,2 ml Transportmedium (bis 9/2023 50 ml Falcon mit 15 ml) aus dem Kühlschrank im Schnellschnitt nehmen.  Bis 9/2023: Vorgelabelte Röhrchen aus dem Unterschrank nehmen und Probennummer auf Gewebeschein notieren. 
Ab 9/2023: Röhrchen mit in den Schnellschnitt nehmen; zu vergebenen Probennummer vorher recherchieren und auf Gewebeschein notieren + Tubes labeln wenn klar ist, dass eine Gewebeentnahme erfolgen kann
Entnahmen durch den Pathologen: 
KriteriumBeschreibung Planung
Makroskopische Heterogenität Falls makroskopisch unterschiedliche Regionen zu erkennen sind, bitte Proben aus den unterschiedlichen Regionen entnehmen. 
Vorbehandlung mit neoadjuvanter chemotherapy Im Falle eines guten Ansprechens auf die neoadjuvante Therapie, möglichst eine Probe aus nicht-viablem Gewebe entnehmen. Rest aus viablen Bereichen. 
Mit einer Stanze 2x (für Frischgewebe und Fresh Frozen) je ein Stück Tumorgewebe entnehmen, welches horizontal in Mucosa- und muskuläre (invasive) Seite geteilt und auf 2 Mediumröhrchen bzw.  2 Kryoröhrchen verteilt wird. Hierbei ist die Beschriftung T1 für die Mucosa und T2 für die Invasive Seite zu verwenden. (Pro 5 cm Durchmesser des Tumors wird eine Probe gesammelt.) 
Mit einem Messer/Skalpell ein möglichst flaches Gewebestück aus dem tumornahen Normalgewebe, welches auf ein Mediumröhrchen und ein Kryoröhrchen aufgeteilt wird.
Dito für ein tumorfernes Normalgewebe.
wenn möglich Fotos der Entnahmestelle machen
Eintragen der Stücke in den Gewebeschein.

Transport des Gewebes ins Labor.

Fresh frozen Lagerung in –70 °C TK im Labor
Aufarbeitung im Labor
Aufarbeitung im Labor
1h
weiter mit Protokoll:
Protocol
Tissue processing and freezing after surgery
NAME
Tissue processing and freezing after surgery
CREATED BY
Bettina Ergün