Cuando se tiene el criovial preparado es el momento de proceder a la congelación, que ha de ser lenta y progresiva (-1ºC/minuto); para ello coger el recipiente de congelación Mr. Frosty y comprobar que contenga el volumen que este requiere de isopropanol, si no lo tiene añadirlo (realizar este paso bajo una campana de extracción de gases), o coger el recipiente de congelación Cooler y comprobar que el anillo térmico se encuentre a la misma temperatura que las células y además el recipiente tiene que estar lleno de criotubos con 1mL (contrapesos para que la congelación sea uniforme).